La historia de "Trigun" sigue a Vash the Stampede, un hombre conocido como el "Tifón Humano" debido a su increíble habilidad con las armas y su fama de causar destrucción a su paso. Sin embargo, Vash es en realidad un pacifista que busca evitar la violencia .

A medida que avanza la historia, se revela que Vash tiene un pasado trágico ligado a la creación de una tecnología avanzada llamada "Noah", que juega un papel crucial en su vida y en el mundo. Vash es perseguido por un grupo de cazarrecompensas, incluidas las agentes Meryl Stryfe y Milly Thompson, quienes intentan documentar su vida y protegerlo de los peligros que lo rodean.

Las revelaciones sobre el pasado de Vash y sus vínculos con su hermano, Knives, se convierten en un tema central de la trama. Knives, un ser poderoso que desprecia a la humanidad, busca erradicar a los humanos que considera inferiores, mientras que Vash lucha por encontrar un camino de paz. Este conflicto entre los hermanos es la clave del desarrollo de la historia.

A lo largo de la serie, Vash se enfrenta a diversos antagonistas y situaciones que ponen a prueba su filosofía de no violencia. A pesar de su reputación, se esfuerza por proteger a las personas, mostrando su bondad y humanidad. La serie presenta múltiples episodios que mezclan acción, humor y momentos emotivos.

Las interacciones de Vash con los personajes secundarios, como Wolfwood, un sacerdote y pistolero con un oscuro pasado, enriquecen la narrativa. Wolfwood se convierte en un amigo y aliado, y su propia lucha moral complementa la búsqueda de Vash por la redención y la paz.

A medida que la historia avanza hacia su clímax, las tensiones entre Vash y Knives aumentan